长荣航空与全日空航空以共挂班号方式全面联营台北─福冈、大阪、东京、名古屋、仙台、札幌等日本定期航线，提供旅客前往日本更完整便捷的运输服务。 另自2008年4月1日起，联营大阪-洛杉矶航线，提供双方旅客往返日、美二地另一选择。

双方合作内容包括共挂班机号码、行李直挂、联航班表协定、机场贵宾室以及订位系统互通等合作，为本公司与外家航空公司合作之滥觞。全日空航空之旅客可透过本公司之营运网络衔接香港、澳门、奥克兰等航线；同时，长荣航空之旅客，亦可透过全日空航空之网络顺利衔接名古屋、宫崎、鹿儿岛、小松等台湾航线。